尿素一般不直接作种肥。因为尿素中含有少量的缩二脲，一般低于2%，缩二脲对种子的发芽和生长均有害。如果不得已作种肥时，可将种子和尿素分开下地，切不可用尿素浸种或拌种。

尿素转化成碳酸氢铵后，在石灰性土壤上易分解挥发，造成氮素损失，因此，尿素施用后要及时深施覆土。